Neuroglancer
谷歌开发的免费查看器程序,可以在网页浏览器中缩放、旋转查看超大规模三维图像数据
简单来说
Neuroglancer是谷歌开发的一款查看器程序,能让人在网页浏览器里自由缩放和旋转查看巨大的三维图像数据。就像谷歌地图无论怎么放大都能流畅显示到每一条道路一样,这个程序把数百万张大脑切片图像拼接成一整块巨大的三维数据,并只在需要时加载显示当下所需的部分。
像大脑神经网络地图这样容量高达数十太字节(TB)的数据,是不可能整体下载打开的。Neuroglancer的解决办法是把这些数据切分后存放在服务器上,只把用户当前在屏幕上看到的部分逐步取回并渲染出来。这样研究者就能像用鼠标伸进大脑里一样自由穿梭,用眼睛追踪单条神经的走向。
由于以开源形式发布,任何人都能免费使用,在绘制果蝇或小鼠大脑神经网络地图的研究中,它被广泛用作确认和验证成果的标准工具。
亲手试一试
Neuroglancer无需安装,可以直接在网页浏览器中打开。访问公开的Neuroglancer页面,选择一个官方提供的示例数据集即可。
- 用鼠标拖动屏幕上的三维画面,旋转查看角度。
- 用滚轮缩放,观察细节结构如何随之变化。
- 点击某个用颜色标出的独立结构(比如一条神经),将其单独选中高亮,便于追踪。
通过这样的操作,可以直观感受到不用下载就能一部分一部分地查看庞大三维数据的方式。