in silico（计算机模拟）

in silico 指的是不用真实细胞或试管,而是在计算机屏幕里做实验。这个词源自拉丁语,意思是「在硅(计算机芯片的材料)之中」,打个比方,就像在真正买食材、开火烹饪之前,先用菜谱程序计算味道和温度。就算失败了,也不会浪费食材,也不用花很长时间,所以可以更快、更便宜地反复尝试。

不过,在计算机里看起来行得通,并不能保证在现实中也真的有效。就像菜谱程序预测某道菜好吃,但不实际做出来吃一口就无法确定一样,用 in silico 方式设计出的结果,最终还是要拿到实验室用真实材料再验证一遍。

文章中提到,Claude 只接收目标蛋白质的信息,用 24 小时生成候选蛋白质并预测其折叠结构,这正是 in silico 的工作方式。随后,Adaptyv Bio 和 GenScript 这两家真实实验室合成了在计算机中筛选出的设计方案,并验证它们是否真的能结合。结果并不是所有在计算机里看起来有希望的设计都真的有效,只有接近一半的设计成功结合。这个案例说明,「计算机选出来的,很快就能变成新药」是一种误解,in silico 的结果必须经过实验室验证才真正具有意义。