K-Dense-AI/scientific-agent-skills

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把AI编程助手变成科研帮手的163份操作手册

这个仓库汇集了163个面向Cursor、Claude Code、Codex等AI代理工具的技能包,每个技能都用文档和示例代码说明如何正确使用某个科学软件或数据库。内容涵盖PubChem、UniProt、ClinicalTrials.gov等100多个数据库,以及RDKit、Scanpy等70多个Python包的用法。每个技能都配有说明文档、示例代码和测试,持续集成会自动检查。

它做什么

提供163份SKILL.md操作说明,覆盖新药筛选、单细胞RNA分析、基因变异标注、临床试验检索等生物、化学、医学、物理等多个科研领域
每个技能都带文档、代码示例和测试用例,凡带脚本的技能必须配套测试,否则拉取请求会被拦截
可通过npx、GitHub CLI(gh skill)或手动复制安装到Cursor、Claude Code、Codex等支持Agent Skills标准的工具中
收录了Anthropic原创的docx、pdf、pptx、xlsx文档处理技能,并通过Cisco AI Defense扫描器每周做安全扫描
提醒用户:安装的技能可以让AI代理执行任意代码、安装软件包、访问网络,因此安装前应先阅读每个SKILL.md

为什么重要

研究者不必每次从零学习某个科学软件库或数据库的调用方法,可以直接把经过验证的操作手册交给AI去执行。但技能可能触发代码执行和网络访问,安装前的审查对安全很重要。

本仓库术语

Agent Skills · 一种让AI代理加载并遵循的标准化操作说明格式
SKILL.md · 每个技能内部描述用途和用法的文档文件
database-lookup · 统一接入78个以上公开科学数据库的单个技能
uv · 用于安装技能所需Python依赖包的工具

仓库简介（英文）

Turn any AI agent into an AI Scientist. The #1 Agent Skills library for science, used by 175,000+ scientists worldwide. 163 ready-to-use validated skills plus 100+ scientific databases covering biology, chemistry, medicine, and drug discovery. Compatible with Cursor, Claude Code, Codex, Pi, Antigravity, and the open Agent Skills standard.

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